A partir de Setembro de 2015, o Thimble suporta projetos com vários ficheiros. Pode adicionar ficheiros HTML, CSS e JavaScript para a árvore de ficheiros do projeto que pode aceder no lado esquerdo da página do Thimble.
O suporte a múltiplos ficheiros permite-lhe criar projetos mais próximos do mundo real que pode distribuir por múltiplos ficheiros e pastas e incluir facilmente outro código fonte aberto no seu projeto. Também pode adicionar ficheiros de imagem a partir do ambiente de trabalho diretamente para o seu projeto. Anteriormente, o Thimble só permitia a adição de imagens baseadas na Web.