La configuración de los temas volverá a su estado predeterminado y tendrás que volver a habilitarlos:

Visita https://addons.mozilla.org/firefox/themes/
Haz clic en el tema que quieras instalar.
Haz clic en el botón Instalar tema. Si cambias de opinión, haz clic en Eliminar. Los cambios se guardarán automáticamente.

Para más información, consulta este artículo o este otro.

Respuesta del foro - Ajustes de temas