Wellicht dat dit artikel wat verheldering levert over Thunderbird en Gmail.

Dank Mark, dat schept wel iets verheldering. Ben nog aan het testen geweest, en blijkbaar is het gedrag anders als je SHIFT+Delete gebruikt i.p.v. Delete. Direct permanent verwijderen met SHIFT+Delete zorgt ervoor dat de e-mail wel uit de INbox wordt gehaald, maar vervolgens wel in "Alle e-mail" blijft staan. De optie permanent verwijderen heb je niet bij web-Gmail, dus eigenlijk moet deze ook niet in Thunderbird beschikbaar zijn. Of is er een manier om Thunderbird zo te configureren dat SHIFT+Delete het e-mail-item zowel uit de Inbox als uit "Alle e-mail" haalt?

Kennelijk werkt het helaas zo; Gmail maakt gebruik van een wat afwijkend protocol, waardoor dit soort zaken kunnen ontstaan. Als ik dit artikel zo lees, komt het gebruik van Shift+Del bij Gmail neer op archiveren, wat het blijven bestaan in de map ‘Alle berichten’ verklaart (daar worden gearchiveerde berichten namelijk standaard geplaatst). In dit artikel wordt dit in wat ingewikkelder termen nog eens beschreven. Ik ben bang dat er geen echte oplossing voor is.