Matheus
No nosso ambiente corporativo varios usuários utilizam o e-mail do setor em diferentes estações com a configuração de POP3 e recentemente estamos com loopings de e-mails nas contas impedindo o recebimento de novas mensagens. Algumas mensagens param de dar loop e uma outra mensagem começa a se repetir, assim sucessivamente, porém no web mail essa repetição não ocorre.
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Generally this is caused by an anti virus product not coping with a malformed mail received on the server. Sometime simply emptying the spam folder will fix it as malformed mail is usually spam. Otherwise you need to fix your anti virus mail scanning so it does not hang when it encounters malformed mail, or turn it off until the issue is cleared (for this time)